Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A1P49279 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms