Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PTPRBP23467 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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