Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms