Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HOXD8P13378 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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