Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms