Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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