Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSPG5O95196 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSPG5O95196 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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