Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLGNO14967 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms