Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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