Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GABRPO00591 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GABRPO00591 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms