Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms