Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB23Q9ULC3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms