Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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