Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LRFN1Q9P244 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LRFN1Q9P244 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRFN1Q9P244 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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