Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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