Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF6Q9BYE7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms