Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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