Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms