Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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