Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms