Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms