Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NUP35Q8NFH5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms