Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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