Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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