Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms