Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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