Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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