Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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