Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN9AQ15858 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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