Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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