Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUM3Q15397 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms