Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms