Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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