Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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