Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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