Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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