Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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