Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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