Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EP300Q09472 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EP300Q09472 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
EP300Q09472 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
EP300Q09472 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
EP300Q09472 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms