Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PPARDQ03181 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms