Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms