Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms