Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN7AQ01118 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN7AQ01118 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms