Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms