Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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