Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CBX1P83916 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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