Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LMO4P61968 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LMO4P61968 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms