Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms