Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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