Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCN5P51795 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms